Между Москвой-рекой и улицей Остоженкой, в районе, который в старину называли Земляным городом, находится Зачатьевский ставропигиальный монастырь – древнейшая женская обитель столицы. Его история восходит к XIV веку.

В 1360 г. свт. Алексий, митрополит Московский, построил деревянную церковь Зачатия прав. Анны и основал при ней монастырь, первыми насельницами которого стали его родные сестры, игумения Иулиания и монахиня Евпраксия. В 1547 г. монастырь был уничтожен пожаром и переведен ближе к Кремлю.

На старом месте осталась лишь небольшая монашеская община, вновь ставшая монастырем в 1584 г. при попечительстве царя Феодора Иоанновича. Тогда же в ней были построены храмы Зачатия прав. Анны с приделом вмч. Феодора Стратилата и мц. Ирины, трапезный храм в честь Рождества Богородицы. Монастырь сильно пострадал во время польского нашествия в 1612 г., но вскоре был возрожден.

В 1696 г. на средства Андрея Римского-Корсакова, вельможи Петра I, был построен надвратный храм Спаса Нерукотворного Образа. В 1766 г. был построен храм во имя иконы Божией Матери «Неопалимая Купина» над могилами основательниц монастыря игумении Иулиании и монахини Евпраксии.

В 1885-1887 гг. храм вошел в состав монастырских сооружений и был образован придел во имя Казанской иконы Божией Матери. В 1804-1807 гг. на месте древних храмов был возведен грандиозный Рождественский собор с приделами Зачатия прав. Анны, вмч. Феодора Стратилата, свт. Алексия, митр. Московского, и Казанской иконы Божией Матери (архит. М.Ф. Казаков). С древних времен в обители была богадельня для престарелых инокинь и рукодельная мастерская. В 1844-1850 гг. для богадельни было построено специальное каменное здание (архит. М.Д. Быковский) с храмом Сошествия Святого Духа. В XIX и XX вв. на территории обители появилось множество жилых и хозяйственных корпусов.

В 1927 г. монастырь был закрыт. Некоторые иконы монастыря были перенесены в храм прор. Илии Обыденного. 16 марта 1925 г., за 9 дней до кончины, здесь служил свою последнюю Литургию свт. Тихон, Патриарх Всероссийский.

В 1930-х гг. собор, колокольня и храм во имя иконы Божией Матери «Неопалимая Купина» были полностью разрушены и на их месте выстроено типовое школьное здание, до неузнаваемости был перестроен храм Сошествия Святого Духа, стены, окружавшие обитель, были частично разрушены. В 1960-е гг. проведена внешняя реставрация надвратного храма, яркого образца стиля «московское барокко».

В 1991 г. сестричеством во имя иконы Божией Матери «Милостивая» были начаты труды по возрождению обители. Богослужения возобновлены в 1993 г.

В 1995 г. указом Священного Синода сестричеству дан статус ставропигиального женского монастыря. 25 ноября 1999 г. торжественным крестным ходом икона Божией Матери «Милостивая» и посох последней игумении были перенесены в Зачатьевский монастырь.

16 мая 2001 г. состоялось прославление Иулиании, первой игумении монастыря, и монахини Евпраксии в лике святых.

В ноябре 2002 г., после перевода средней школы в другое строение, было разобрано школьное здание. С весны 2003 г. начали производиться археологические изыскания. В результате раскопок и исследований были собраны уникальные коллекции нательных крестов, образков, богослужебных предметов, монет, керамики, обнаружено большое количество надгробных плит и захоронений. Были открыты остатки фундаментов и архитектурные фрагменты всех четырех соборных храмов.

5 ноября 2005 г., в день празднования иконе Божией Матери «Милостивая», Святейший Патриарх Алексий II совершил закладку камня в основание собора Рождества Пресвятой Богородицы.

25 ноября 2008 г. архиепископ Истринский Арсений совершил чин освящения 11 колоколов соборной звонницы.

25 ноября 2009 г. Святейший Патриарх Кирилл совершил освящение 5 больших и 3 малых крестов, установленных в тот же день на купола строящегося собора.

16 сентября 2010 г. состоялось малое освящение первого из приделов Богородице-Рождественского собора — в честь иконы Божией Матери «Неопалимая Купина». 17 сентября, в день престольного праздника храма, была совершена первая Божественная литургия. Богослужение возглавил архиепископ Истринский Арсений. 4 ноября первую Литургию служили в Казанском приделе собора, накануне освященным малым чином.

25 ноября 2010 г. Святейший Патриарх Кирилл совершил великое освящение и первую Божественную литургию в восстановленном соборе Рождества Пресвятой Богородицы. Были освящены 7 престолов: Рождества Богородицы (главный), св. правв. богоотец Иоакима и Анны, святителя Алексия и прп. Алексия, человека Божия, сщмч. Киприана и мц. Иустины, прпп. Иулиании и Евпраксии Московских, Казанской иконы Божией Матери и иконы Пресвятой Богородицы «Неопалимая Купина». Еще 3 придела ― св. вмч. Димитрия Солунского, св. блгв. кн. Иулиании Вяземской и придел Всех преподобных отцев и матерей ― находятся в процессе устроения.

Накануне праздника во время всенощного бдения был совершен перенос чудотворного образа Божией Матери «Милостивая» из храма Сошествия Святого Духа в собор, где для иконы был устроен особый белокаменный резной киот с шатровой сенью.

Святыни

Икона Божией Матери «Милостивая»; крест-распятие с частицами Крови Христовой, древа Креста и Гроба Господня, икона вмч. Георгия Победоносца, вмч. Пантелеимона с частицей мощей; икона Зачатия св. прав. Анны, мощевик с частицами святых мощей новомучеников и исповедников Российских. Особо почитается место погребения основательниц монастыря игумении Иулиании и монахини Евпраксии.

В новом трапезном корпусе устроен и освящен храм Зачатия св. прав. Анны, под надвратным храмом построена и освящена часовня в честь свт. Алексия, митр. Московского. В монастыре ведутся ремонтно-восстановительные, реставрационные работы. В 2001 г. начаты работы по реконструкции храма Сошествия Святого Духа.